Forvaltningsmyndigheten for verneområdene i Vega kommune er delegert til Vega verneområdestyre som består av tre politiske representanter; to fra Vega kommune og en fra Nordland fylkeskommune. Sekretariatet for verneområdestyret er verneområdeforvalter som er ansatt hos Fylkesmannen i Nordland, men med lokalt kontorsted. Styret skal sørge for at forvaltningen av verneområdene gjennomføres i samsvar med verneforskriftene
for de enkelte verneområdene, naturmangfoldloven, nasjonale miljømål og internasjonale forpliktelser.
Nytt styre ble konstituert 16.mars 2020, med følgende medlemmer:
- For Vega kommune: medlem Andre Møller (leder), vara Hilde Sprækenhus.
- For Vega kommune: medlem Eirin Sannes Sleteng (nestleder), vara Per-Anton Nesjan.
- For Nordland fylkeskommune: medlem Knut Petter Torgersen, vara Kari Anne Bøkestad Andreassen.
Jannike Wika er ansatt som verneområdeforvalter hos Statsforvalteren i Nordland og er sekretær for styret.