Formålet med Lofotodden nasjonalpark er å bevare et stort naturområde som inneholder et særegent naturmangfold med særlig vekt på landskap uten tyngre naturinngrep, naturtyper, arter og geologiske forekomster. Formålet med nasjonalparken er videre å ta vare på: a) et unikt og kystalpint landskap med svært stor landskaps- og naturhistorisk verdi b) representative og særegne økosystemer med variasjonsbredden i naturmangfold, herunder arter, bestander, naturtyper, geologi og økologiske prosesser c) genetiske særtrekk hos fjellplanter i ett av områdene i Norge som har vært isfritt lengst og hos oseaniske arter på nordgrensa av sitt utbredelsesområde d) viktige naturtyper som ur og rasmark, kalkrike kystfjell og sanddyner e) artsrike områder i naturtypene kulturmarkseng og boreal hei f) leveområde for flere trua arter, herunder krykkje, teist, toppskarv og beitemarkssopp g) verdifulle kulturminner h) et viktig referanseområde for å studere utvikling i naturen, spesielt knyttet til geologiske prosesser, klimaendring og betydning beite har for etablering av skog i nordlige områder med oseanisk klima. Allmennheten skal gis anledning til uforstyrret opplevelse av naturen gjennom utøvelse av naturvennlig og enkelt friluftsliv med liten grad av teknisk tilrettelegging.